Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms