Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabra5Q8BHJ7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms