Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe23Q8BGW3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms