Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg4dQ8BGV9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms