Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vipas39Q8BGQ1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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Vipas39Q8BGQ1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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Vipas39Q8BGQ1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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Vipas39Q8BGQ1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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Vipas39Q8BGQ1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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Vipas39Q8BGQ1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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