Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Jmjd4Q8BFT6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms