Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc50Q810U5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc50Q810U5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms