Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem39bQ810L4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem39bQ810L4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem39bQ810L4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem39bQ810L4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem39bQ810L4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem39bQ810L4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem39bQ810L4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem39bQ810L4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem39bQ810L4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem39bQ810L4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem39bQ810L4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem39bQ810L4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms