Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChfrQ810L3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms