Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZA4

Pkhd1l1, Fibrocystin-L, mousemouse

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Length 4,249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1l1Q80ZA4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pkhd1l1Q80ZA4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkhd1l1Q80ZA4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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