Protein–RNA interactions for Protein: Q80YV3

Trrap, Transformation/transcription domain-associated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrrapQ80YV3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms