Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc27Q80YS5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc27Q80YS5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc27Q80YS5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc27Q80YS5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc27Q80YS5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc27Q80YS5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc27Q80YS5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc27Q80YS5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc27Q80YS5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc27Q80YS5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc27Q80YS5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc27Q80YS5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc27Q80YS5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc27Q80YS5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc27Q80YS5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc27Q80YS5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc27Q80YS5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc27Q80YS5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc27Q80YS5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc27Q80YS5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc27Q80YS5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc27Q80YS5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc27Q80YS5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc27Q80YS5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc27Q80YS5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc27Q80YS5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc27Q80YS5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc27Q80YS5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc27Q80YS5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc27Q80YS5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc27Q80YS5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc27Q80YS5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Lrrc27Q80YS5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc27Q80YS5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Lrrc27Q80YS5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc27Q80YS5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc27Q80YS5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc27Q80YS5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc27Q80YS5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc27Q80YS5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc27Q80YS5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc27Q80YS5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc27Q80YS5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc27Q80YS5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc27Q80YS5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc27Q80YS5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc27Q80YS5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc27Q80YS5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc27Q80YS5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Lrrc27Q80YS5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc27Q80YS5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc27Q80YS5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc27Q80YS5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc27Q80YS5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc27Q80YS5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Lrrc27Q80YS5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc27Q80YS5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc27Q80YS5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Lrrc27Q80YS5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc27Q80YS5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Lrrc27Q80YS5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Lrrc27Q80YS5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc27Q80YS5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc27Q80YS5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Lrrc27Q80YS5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc27Q80YS5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc27Q80YS5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc27Q80YS5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc27Q80YS5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc27Q80YS5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc27Q80YS5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc27Q80YS5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc27Q80YS5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc27Q80YS5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc27Q80YS5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc27Q80YS5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc27Q80YS5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc27Q80YS5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc27Q80YS5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc27Q80YS5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc27Q80YS5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc27Q80YS5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc27Q80YS5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc27Q80YS5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc27Q80YS5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc27Q80YS5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc27Q80YS5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc27Q80YS5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc27Q80YS5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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