Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ell3Q80VR2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ell3Q80VR2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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