Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc155Q80VJ8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms