Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf8Q80TJ7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Phf8Q80TJ7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Phf8Q80TJ7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Phf8Q80TJ7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Phf8Q80TJ7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Phf8Q80TJ7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Phf8Q80TJ7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Phf8Q80TJ7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Phf8Q80TJ7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Phf8Q80TJ7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf8Q80TJ7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf8Q80TJ7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf8Q80TJ7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf8Q80TJ7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf8Q80TJ7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf8Q80TJ7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf8Q80TJ7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf8Q80TJ7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf8Q80TJ7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms