Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cdc42bpbQ7TT50 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdc42bpbQ7TT50 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdc42bpbQ7TT50 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdc42bpbQ7TT50 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdc42bpbQ7TT50 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdc42bpbQ7TT50 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdc42bpbQ7TT50 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdc42bpbQ7TT50 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdc42bpbQ7TT50 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdc42bpbQ7TT50 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdc42bpbQ7TT50 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdc42bpbQ7TT50 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdc42bpbQ7TT50 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdc42bpbQ7TT50 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdc42bpbQ7TT50 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdc42bpbQ7TT50 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdc42bpbQ7TT50 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdc42bpbQ7TT50 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdc42bpbQ7TT50 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdc42bpbQ7TT50 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdc42bpbQ7TT50 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdc42bpbQ7TT50 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdc42bpbQ7TT50 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdc42bpbQ7TT50 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdc42bpbQ7TT50 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdc42bpbQ7TT50 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdc42bpbQ7TT50 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdc42bpbQ7TT50 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdc42bpbQ7TT50 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdc42bpbQ7TT50 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdc42bpbQ7TT50 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdc42bpbQ7TT50 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdc42bpbQ7TT50 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms