Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clec18aQ7TSQ1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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