Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClmQ7TSN2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms