Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf516Q7TSH3 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf516Q7TSH3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf516Q7TSH3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf516Q7TSH3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf516Q7TSH3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf516Q7TSH3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf516Q7TSH3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf516Q7TSH3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf516Q7TSH3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf516Q7TSH3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf516Q7TSH3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf516Q7TSH3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf516Q7TSH3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf516Q7TSH3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf516Q7TSH3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf516Q7TSH3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf516Q7TSH3 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf516Q7TSH3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf516Q7TSH3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf516Q7TSH3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf516Q7TSH3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf516Q7TSH3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf516Q7TSH3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.1 ms