Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prrc2bQ7TPM1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Prrc2bQ7TPM1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prrc2bQ7TPM1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms