Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sbno2Q7TNB8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sbno2Q7TNB8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sbno2Q7TNB8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sbno2Q7TNB8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sbno2Q7TNB8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sbno2Q7TNB8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sbno2Q7TNB8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sbno2Q7TNB8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sbno2Q7TNB8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms