Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed3Q78IS1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed3Q78IS1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms