Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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