Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl35Q6ZWV7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms