Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Syne2Q6ZWQ0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Syne2Q6ZWQ0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Syne2Q6ZWQ0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Syne2Q6ZWQ0 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Syne2Q6ZWQ0 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Syne2Q6ZWQ0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Syne2Q6ZWQ0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Syne2Q6ZWQ0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Syne2Q6ZWQ0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Syne2Q6ZWQ0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Syne2Q6ZWQ0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Syne2Q6ZWQ0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Syne2Q6ZWQ0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Syne2Q6ZWQ0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Syne2Q6ZWQ0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Syne2Q6ZWQ0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Syne2Q6ZWQ0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Syne2Q6ZWQ0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Syne2Q6ZWQ0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Syne2Q6ZWQ0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Syne2Q6ZWQ0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Syne2Q6ZWQ0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Syne2Q6ZWQ0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Syne2Q6ZWQ0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Syne2Q6ZWQ0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Syne2Q6ZWQ0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Syne2Q6ZWQ0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Syne2Q6ZWQ0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Syne2Q6ZWQ0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC8.09□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Syne2Q6ZWQ0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms