Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ncapd3Q6ZQK0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms