Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NinlQ6ZQ12 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NinlQ6ZQ12 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NinlQ6ZQ12 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
NinlQ6ZQ12 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NinlQ6ZQ12 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
NinlQ6ZQ12 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NinlQ6ZQ12 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NinlQ6ZQ12 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NinlQ6ZQ12 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NinlQ6ZQ12 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NinlQ6ZQ12 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NinlQ6ZQ12 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NinlQ6ZQ12 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NinlQ6ZQ12 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NinlQ6ZQ12 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NinlQ6ZQ12 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NinlQ6ZQ12 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NinlQ6ZQ12 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NinlQ6ZQ12 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NinlQ6ZQ12 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NinlQ6ZQ12 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NinlQ6ZQ12 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NinlQ6ZQ12 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NinlQ6ZQ12 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NinlQ6ZQ12 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NinlQ6ZQ12 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NinlQ6ZQ12 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NinlQ6ZQ12 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NinlQ6ZQ12 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NinlQ6ZQ12 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NinlQ6ZQ12 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NinlQ6ZQ12 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms