Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Znf653Q6YND2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Znf653Q6YND2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Znf653Q6YND2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Znf653Q6YND2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Znf653Q6YND2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Znf653Q6YND2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Znf653Q6YND2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Znf653Q6YND2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Znf653Q6YND2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Znf653Q6YND2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Znf653Q6YND2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Znf653Q6YND2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Znf653Q6YND2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Znf653Q6YND2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Znf653Q6YND2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Znf653Q6YND2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Znf653Q6YND2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Znf653Q6YND2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Znf653Q6YND2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Znf653Q6YND2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Znf653Q6YND2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Znf653Q6YND2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Znf653Q6YND2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Znf653Q6YND2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Znf653Q6YND2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Znf653Q6YND2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Znf653Q6YND2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Znf653Q6YND2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Znf653Q6YND2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Znf653Q6YND2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Znf653Q6YND2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Znf653Q6YND2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Znf653Q6YND2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Znf653Q6YND2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Znf653Q6YND2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Znf653Q6YND2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Znf653Q6YND2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Znf653Q6YND2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Znf653Q6YND2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Znf653Q6YND2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms