Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rhox8Q6VSS7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rhox8Q6VSS7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rhox8Q6VSS7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rhox8Q6VSS7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rhox8Q6VSS7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rhox8Q6VSS7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rhox8Q6VSS7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rhox8Q6VSS7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rhox8Q6VSS7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Rhox8Q6VSS7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Rhox8Q6VSS7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Rhox8Q6VSS7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Rhox8Q6VSS7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Rhox8Q6VSS7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Rhox8Q6VSS7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Rhox8Q6VSS7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Rhox8Q6VSS7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Rhox8Q6VSS7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Rhox8Q6VSS7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Rhox8Q6VSS7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Rhox8Q6VSS7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Rhox8Q6VSS7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Rhox8Q6VSS7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Rhox8Q6VSS7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Rhox8Q6VSS7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Rhox8Q6VSS7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Rhox8Q6VSS7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Rhox8Q6VSS7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Rhox8Q6VSS7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Rhox8Q6VSS7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Rhox8Q6VSS7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Rhox8Q6VSS7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Rhox8Q6VSS7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Rhox8Q6VSS7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Rhox8Q6VSS7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Rhox8Q6VSS7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Rhox8Q6VSS7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Rhox8Q6VSS7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Rhox8Q6VSS7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Rhox8Q6VSS7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rhox8Q6VSS7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rhox8Q6VSS7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rhox8Q6VSS7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rhox8Q6VSS7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rhox8Q6VSS7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rhox8Q6VSS7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rhox8Q6VSS7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rhox8Q6VSS7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rhox8Q6VSS7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rhox8Q6VSS7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Rhox8Q6VSS7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rhox8Q6VSS7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rhox8Q6VSS7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rhox8Q6VSS7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rhox8Q6VSS7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rhox8Q6VSS7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rhox8Q6VSS7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rhox8Q6VSS7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rhox8Q6VSS7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Rhox8Q6VSS7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Rhox8Q6VSS7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Rhox8Q6VSS7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Rhox8Q6VSS7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Rhox8Q6VSS7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Rhox8Q6VSS7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Rhox8Q6VSS7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms