Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ift172Q6VH22 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms