Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt9Q6RHW0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt9Q6RHW0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt9Q6RHW0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt9Q6RHW0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt9Q6RHW0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt9Q6RHW0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt9Q6RHW0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt9Q6RHW0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt9Q6RHW0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt9Q6RHW0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt9Q6RHW0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt9Q6RHW0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt9Q6RHW0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt9Q6RHW0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt9Q6RHW0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt9Q6RHW0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt9Q6RHW0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt9Q6RHW0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt9Q6RHW0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt9Q6RHW0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt9Q6RHW0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms