Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHU5

Sort1, Sortilin, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sort1Q6PHU5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sort1Q6PHU5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms