Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF5

Bms1, BMS1 homolog, ribosome assembly protein (Yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bms1Q6PGF5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bms1Q6PGF5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms