Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad54bQ6PFE3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad54bQ6PFE3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad54bQ6PFE3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad54bQ6PFE3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad54bQ6PFE3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad54bQ6PFE3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad54bQ6PFE3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad54bQ6PFE3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad54bQ6PFE3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad54bQ6PFE3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad54bQ6PFE3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad54bQ6PFE3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad54bQ6PFE3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad54bQ6PFE3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad54bQ6PFE3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad54bQ6PFE3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad54bQ6PFE3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad54bQ6PFE3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad54bQ6PFE3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad54bQ6PFE3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad54bQ6PFE3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad54bQ6PFE3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms