Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms