Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trak1Q6PD31 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trak1Q6PD31 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms