Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gapvd1Q6PAR5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gapvd1Q6PAR5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gapvd1Q6PAR5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gapvd1Q6PAR5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gapvd1Q6PAR5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gapvd1Q6PAR5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gapvd1Q6PAR5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gapvd1Q6PAR5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Gapvd1Q6PAR5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gapvd1Q6PAR5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gapvd1Q6PAR5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gapvd1Q6PAR5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gapvd1Q6PAR5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gapvd1Q6PAR5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gapvd1Q6PAR5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gapvd1Q6PAR5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gapvd1Q6PAR5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Gapvd1Q6PAR5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Gapvd1Q6PAR5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms