Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM0

Prkab2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab2Q6PAM0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prkab2Q6PAM0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prkab2Q6PAM0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prkab2Q6PAM0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prkab2Q6PAM0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prkab2Q6PAM0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prkab2Q6PAM0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prkab2Q6PAM0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prkab2Q6PAM0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prkab2Q6PAM0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prkab2Q6PAM0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prkab2Q6PAM0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Prkab2Q6PAM0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prkab2Q6PAM0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prkab2Q6PAM0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prkab2Q6PAM0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prkab2Q6PAM0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prkab2Q6PAM0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prkab2Q6PAM0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prkab2Q6PAM0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prkab2Q6PAM0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Prkab2Q6PAM0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prkab2Q6PAM0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prkab2Q6PAM0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prkab2Q6PAM0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms