Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slf2Q6P9P0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms