Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9K8

Caskin1, Caskin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caskin1Q6P9K8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Caskin1Q6P9K8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Caskin1Q6P9K8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Caskin1Q6P9K8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Caskin1Q6P9K8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Caskin1Q6P9K8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Caskin1Q6P9K8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Caskin1Q6P9K8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Caskin1Q6P9K8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Caskin1Q6P9K8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Caskin1Q6P9K8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Caskin1Q6P9K8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Caskin1Q6P9K8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Caskin1Q6P9K8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Caskin1Q6P9K8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Caskin1Q6P9K8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Caskin1Q6P9K8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Caskin1Q6P9K8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Caskin1Q6P9K8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Caskin1Q6P9K8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Caskin1Q6P9K8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Caskin1Q6P9K8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Caskin1Q6P9K8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Caskin1Q6P9K8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Caskin1Q6P9K8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Caskin1Q6P9K8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Caskin1Q6P9K8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Caskin1Q6P9K8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Caskin1Q6P9K8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Caskin1Q6P9K8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Caskin1Q6P9K8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Caskin1Q6P9K8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Caskin1Q6P9K8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Caskin1Q6P9K8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Caskin1Q6P9K8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Caskin1Q6P9K8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Caskin1Q6P9K8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Caskin1Q6P9K8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Caskin1Q6P9K8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Caskin1Q6P9K8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Caskin1Q6P9K8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Caskin1Q6P9K8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Caskin1Q6P9K8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Caskin1Q6P9K8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Caskin1Q6P9K8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Caskin1Q6P9K8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Caskin1Q6P9K8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Caskin1Q6P9K8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms