Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Podnl1Q6P3Y9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Podnl1Q6P3Y9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Podnl1Q6P3Y9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Podnl1Q6P3Y9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Podnl1Q6P3Y9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Podnl1Q6P3Y9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Podnl1Q6P3Y9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Podnl1Q6P3Y9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms