Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ptpdc1Q6NZK8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms