Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fndc3bQ6NWW9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fndc3bQ6NWW9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fndc3bQ6NWW9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fndc3bQ6NWW9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fndc3bQ6NWW9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fndc3bQ6NWW9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fndc3bQ6NWW9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fndc3bQ6NWW9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fndc3bQ6NWW9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fndc3bQ6NWW9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fndc3bQ6NWW9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fndc3bQ6NWW9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fndc3bQ6NWW9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Fndc3bQ6NWW9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fndc3bQ6NWW9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fndc3bQ6NWW9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fndc3bQ6NWW9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms