Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn11Q6J756 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms