Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Tpm4Q6IRU2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm4Q6IRU2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm4Q6IRU2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm4Q6IRU2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm4Q6IRU2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm4Q6IRU2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm4Q6IRU2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm4Q6IRU2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm4Q6IRU2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm4Q6IRU2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm4Q6IRU2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm4Q6IRU2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm4Q6IRU2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm4Q6IRU2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm4Q6IRU2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm4Q6IRU2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm4Q6IRU2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm4Q6IRU2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm4Q6IRU2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm4Q6IRU2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm4Q6IRU2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm4Q6IRU2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm4Q6IRU2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm4Q6IRU2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm4Q6IRU2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm4Q6IRU2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm4Q6IRU2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm4Q6IRU2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm4Q6IRU2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tpm4Q6IRU2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tpm4Q6IRU2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tpm4Q6IRU2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tpm4Q6IRU2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tpm4Q6IRU2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tpm4Q6IRU2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tpm4Q6IRU2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tpm4Q6IRU2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms