Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms