Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Smarca2Q6DIC0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Smarca2Q6DIC0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Smarca2Q6DIC0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Smarca2Q6DIC0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Smarca2Q6DIC0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Smarca2Q6DIC0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Smarca2Q6DIC0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Smarca2Q6DIC0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Smarca2Q6DIC0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Smarca2Q6DIC0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Smarca2Q6DIC0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Smarca2Q6DIC0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Smarca2Q6DIC0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Smarca2Q6DIC0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Smarca2Q6DIC0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Smarca2Q6DIC0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Smarca2Q6DIC0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Smarca2Q6DIC0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Smarca2Q6DIC0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Smarca2Q6DIC0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Smarca2Q6DIC0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Smarca2Q6DIC0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Smarca2Q6DIC0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Smarca2Q6DIC0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Smarca2Q6DIC0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Smarca2Q6DIC0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Smarca2Q6DIC0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Smarca2Q6DIC0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Smarca2Q6DIC0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Smarca2Q6DIC0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Smarca2Q6DIC0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Smarca2Q6DIC0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Smarca2Q6DIC0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Smarca2Q6DIC0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Smarca2Q6DIC0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Smarca2Q6DIC0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Smarca2Q6DIC0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Smarca2Q6DIC0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Smarca2Q6DIC0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Smarca2Q6DIC0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Smarca2Q6DIC0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Smarca2Q6DIC0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Smarca2Q6DIC0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Smarca2Q6DIC0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Smarca2Q6DIC0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Smarca2Q6DIC0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Smarca2Q6DIC0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Smarca2Q6DIC0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Smarca2Q6DIC0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Smarca2Q6DIC0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Smarca2Q6DIC0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Smarca2Q6DIC0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Smarca2Q6DIC0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Smarca2Q6DIC0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Smarca2Q6DIC0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Smarca2Q6DIC0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Smarca2Q6DIC0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Smarca2Q6DIC0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Smarca2Q6DIC0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Smarca2Q6DIC0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Smarca2Q6DIC0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Smarca2Q6DIC0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Smarca2Q6DIC0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Smarca2Q6DIC0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Smarca2Q6DIC0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Smarca2Q6DIC0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Smarca2Q6DIC0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Smarca2Q6DIC0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Smarca2Q6DIC0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Smarca2Q6DIC0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Smarca2Q6DIC0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Smarca2Q6DIC0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Smarca2Q6DIC0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Smarca2Q6DIC0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Smarca2Q6DIC0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Smarca2Q6DIC0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Smarca2Q6DIC0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Smarca2Q6DIC0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Smarca2Q6DIC0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Smarca2Q6DIC0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Smarca2Q6DIC0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Smarca2Q6DIC0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Smarca2Q6DIC0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Smarca2Q6DIC0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Smarca2Q6DIC0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Smarca2Q6DIC0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Smarca2Q6DIC0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Smarca2Q6DIC0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Smarca2Q6DIC0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Smarca2Q6DIC0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Smarca2Q6DIC0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Smarca2Q6DIC0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Smarca2Q6DIC0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Smarca2Q6DIC0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Smarca2Q6DIC0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Smarca2Q6DIC0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Smarca2Q6DIC0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Smarca2Q6DIC0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms