Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6DFW0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6DFW0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q6DFW0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Q6DFW0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Q6DFW0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q6DFW0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q6DFW0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q6DFW0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q6DFW0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q6DFW0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q6DFW0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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