Protein–RNA interactions for Protein: Q6A065

Cep170, Centrosomal protein of 170 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170Q6A065 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cep170Q6A065 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cep170Q6A065 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cep170Q6A065 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cep170Q6A065 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cep170Q6A065 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cep170Q6A065 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cep170Q6A065 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cep170Q6A065 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Cep170Q6A065 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cep170Q6A065 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Cep170Q6A065 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cep170Q6A065 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cep170Q6A065 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cep170Q6A065 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cep170Q6A065 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cep170Q6A065 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cep170Q6A065 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cep170Q6A065 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cep170Q6A065 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Cep170Q6A065 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms