Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ric1Q69ZJ7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ric1Q69ZJ7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ric1Q69ZJ7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ric1Q69ZJ7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ric1Q69ZJ7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ric1Q69ZJ7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ric1Q69ZJ7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ric1Q69ZJ7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ric1Q69ZJ7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ric1Q69ZJ7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ric1Q69ZJ7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ric1Q69ZJ7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ric1Q69ZJ7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ric1Q69ZJ7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ric1Q69ZJ7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ric1Q69ZJ7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ric1Q69ZJ7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ric1Q69ZJ7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ric1Q69ZJ7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ric1Q69ZJ7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ric1Q69ZJ7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ric1Q69ZJ7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ric1Q69ZJ7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ric1Q69ZJ7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ric1Q69ZJ7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ric1Q69ZJ7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ric1Q69ZJ7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ric1Q69ZJ7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ric1Q69ZJ7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ric1Q69ZJ7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ric1Q69ZJ7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ric1Q69ZJ7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ric1Q69ZJ7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ric1Q69ZJ7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ric1Q69ZJ7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ric1Q69ZJ7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ric1Q69ZJ7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ric1Q69ZJ7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ric1Q69ZJ7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ric1Q69ZJ7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ric1Q69ZJ7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ric1Q69ZJ7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ric1Q69ZJ7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ric1Q69ZJ7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ric1Q69ZJ7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ric1Q69ZJ7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms